東京都は１０日までの東京の累計感染者数を計４８６８人と発表したが、感染者を再集計する過程で１００人ほどの漏れが確認されたと、読売新聞が１１日報じた。同紙は複数の保健所が東京都に感染者現況を報告する過程で多数の漏れや重複などのミスがあったと伝えた。東京都の関係者は端末に入力した感染者の事例を手書きでまた報告する保健所もあったとし、「集計システムが統一されていないことが一つの要因」と指摘した。

小池百合子東京都知事もこの日午後の会見で「都内の保健所で計１１１人分の報告漏れと、３５人分の重複があった」と述べ、重複記載などのミスも数件確認されて詳しい経緯を調べている、と明らかにした。続いて「発症から療養までを一元的に管理するセンターを設立し、これまでのデータを精査する中で報告漏れなどが判明した」と説明した。今後は中央政府および保健所と協力体系を強化し、正確な情報が迅速に伝えられるように努力すると話した。

同紙は、保健所が感染者の情報管理以外にも電話相談対応や感染経路の調査など多くの業務を抱えており、負担が過大になっていることも背景にある、と分析した。

一方、政府の新型コロナウイルス感染症対策専門家会議の尾身茂副座長はこの日の参議院予算委員会で、「１万５０００人を超えた日本国内の感染者数は１０万人以上いるのでは」という質問に対し、「報告より（感染者）数が多いことは間違いないが、それが１０倍か、１５倍か、２０倍かというのは誰にも分からない」と答えた。続いて「統計学的にはあり得るが、感染者数は把握できず回答できない」とし「軽症者や無症状者が多く、現在行われる検査システムでは（日本国内の）全体感染者数を把握するのは難しい」と述べた。