日本政府は、慰安婦問題の合意についての履行を強調しながら韓日関係の改善に対する期待を示した。日本の安倍晋三首相は２８日、韓日外相会談で慰安婦問題が合意した後、朴槿恵（パク・クネ）大統領に電話をかけて「慰安婦被害者の方々の名誉と尊厳の回復、心の傷の癒しのための事業を着実に実施していく」と話した。

これに先立ち鈴木宗男・元衆議院議員と会った席では「互いに信頼関係をもとに（合意事項を）履行していく」と明らかにした。安倍首相はまた記者たちに「私たちの子や孫、その先の世代の子どもたちに、謝罪し続ける宿命を背負わせるわきにはいかない。今回は、その決意を実行に移すための合意」として「その決議を実行に移すための合意」と説明した。さらに「最終的かつ不可逆的な妥結を（韓日国交正常化）５０周年の年にすることができた」として「韓日両国が力を合わせて新たな時代を切り開くきっかけにしたい」と強調した。

岸田文雄外相は会談後、日本の記者たちに「今回の合意で最終的かつ不可逆的な（慰安婦問題の）解決を確認した」として「歴史的かつ画期的な成果」と話した。ソウルの在韓日本大使館前にある慰安婦少女像については「適切に移転されるものと認識している」とした。また、韓日間の合意事項である新しい慰安婦支援財団の設立に関しては「賠償ではない」として「（被害者の）名誉と尊厳の癒しのための事業を行う」と明らかにした。

日帝の植民地支配についておわび・謝罪した村山談話の主人公である村山富市元首相はこの日の合意について「（日本）政府が公式に責任を認めたものと評価できる」と話した。彼はこの日、大分市で記者会見を行って「安倍首相がよく決断したと思う」と述べてこのように明らかにした。日本のメディアは韓日間の軍の慰安婦合意妥結の便りを緊急ニュースで伝えた。ＮＨＫは韓日外相の記者会見を生放送しながら尹炳世（ユン・ビョンセ）外交部長官の発言も同時通訳で伝えた。日本の新聞は今回の合意が最終的かつ不可逆的だということに焦点を合わせて報道した。

日本の専門家たちは安倍首相がおわびをしたことについて評価しながらも韓国内の世論の動向に注目した。木宮正史・東京大学教授は「日韓双方が譲歩できない部分を守ったという点でお互いの知恵が発揮された合意」として「特に安倍首相の過去の政治的言動が、この合意とは正反対のことを主張してきたという点を考慮すれば首相が決断を下したこと」と話した。平井久志・立命館大学客員教授も「当初は河野談話に否定的だった安倍政権において、日韓外相会談という公式席上で軍の関与と日本国家としての責任の表明、安倍首相が心からのおわびと反省を表明したことは進展」と評価した。だが「これが慰安婦問題に終止符を打つことができるかは韓国内の世論を見守らなければならない」と話した。